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注册个体工商户交社保是合法的。

个体工商户属于用人单位，应当为职工缴纳社会保险，如果以个体工商户身份参保，可以选择参加城镇职工基本养老保险和基本医疗保险，具体的参保手续和流程可能因地区而异，建议咨询当地社保机构获取详细信息，个体工商户应当依法为员工缴纳社保，保障员工的合法权益。

仅供参考，建议咨询专业的法律人士以获得更准确的建议。